Analiza VNS-a (vegetative nervous system – vegetativni živčani sustav) razvijena je u suradnji s vodećim stručnjacima u području HRV, i na njihov savjet ograničena na mali broj ispitivanih parametara. Najvažnija pitanja relevantna za HRV analizu su funkcionirnje simpatikusa i parasimpatikusa, te stanje vegetativne regulacije individualnog pacijenta.